血色十字军的结构类似于军事组织。他们受到阿比迪斯和伊森利恩的领导，其中阿比迪斯是对外宣称的官方领导人。他将自己比作十字军的手臂，而把伊森利恩称为心脏。阿比迪斯在提尔之手负责东瘟疫之地的军事打击行动。而伊森利恩在西瘟疫之地以总检察官的身份统领着十字军的牧师