承接《蜘蛛侠：英雄远征》，讲述了蜘蛛侠的生活因曝光身份而陷入混乱，甚至遭到了全世界民众的愤怒抗议，为改变这一切，蜘蛛侠前往寻求奇异博士的帮助，没料想，多元宇宙打开后更大的危机也随之而来的故事。蜘蛛侠与奇异博士再度联手打响时空混战。为了解决身份暴露危机，蜘蛛