游戏方式一样是战旗策略游戏，但登场作品就完全不同了，超级机器人大战系列除了高达之外还会有很多不同的机战作品登场，比如勇者王GGG，反叛的鲁鲁修，天元突破，传说巨神伊迪安等等，而SD高达系列则是除了原创机体之外登场作品全部都是高达系列