进化石在心金魂银版中的神奇全能巨蛋里可以用竞技点数兑换，不同的日期可以兑换到不同的进化石，没有数量限制。

另外，特性「捡拾」也可以有一定几率获得进化石。

光之石：钢铁岛（DPPt），228号道路（DPPt），14号道路（HGSS），神奇全能巨蛋（HGSS，日一三四六），自然公园（HGSS），捕虫大会第一名奖品（HGSS）

暗之石：银河队总部（DPPt），冠军之路（DPPt），迷幻洞窟（Pt），17号道路（HGSS），神奇全能巨蛋（HGSS，一二四五六），捕虫大会第一名奖品（HGSS），华蓝洞窟（HGSS）

觉醒石：212号道路（Pt），225号道路（DPPt），天冠山（DPPt），17号道路（HGSS），神奇全能巨蛋（HGSS，一二四五六），捕虫大会第一名奖品（HGSS），白银山（HGSS）

（以上DP代表钻石珍珠版，Pt代表白金版，HGSS代表心金魂银版）

波克比的捕捉地点在钻石版中：230号道路（使用神奇追踪，就是收集全国图鉴之后山梨博士给你的那个东西，100步充电，在草丛中用会让有野生神奇宝贝的草丛摇动的东西。要用那个，然后踩那些有闪光点的草丛才可能碰见，出现率稀有）