闪的情况我遇到过。

直接解决办法，不选窗口化。具体原因如下：

因为魔兽在所有进程中默认为置顶，也就是自动放置于所有程序的最顶端。此时即使你用ALT+TAB切换到别的程序你也会发现魔兽处于第二置顶的位置，在其他程序之上。

我双开的时候出现过闪的情况，是因为我选择的窗口化，两个魔兽窗口争相置顶，就引起了互相闪。假如我双开的俩号是A和B，假如A选择窗口化，而B不是窗口化，则切换到A时，屏幕不闪。这说明窗口化的置顶能力比非窗口化强。

而你没有双开就闪，说明有一个同样具有强大置顶能力的程序在跟魔兽争，类似于我双开。

因此我认为楼主可以改成全屏而不用窗口化，这样类似于我上面举的A和B的例子，希望问题可以解决。