2000年，Brain's Base制作并发行了名为《真盖塔对新盖塔》的OVA作品，首次出现在超级机器人大战R中。故事围绕着恐龙帝国的威胁展开，五年前，龙马因失忆未能参战，巴武藏独自驾驶盖塔成功击败敌人。五年后，恐龙帝国卷土重来，日本NISAR基地因盖塔线的危险被禁止研发，神隼人司令员推动了新盖塔的研发，同时寻找新的驾驶员来对抗敌人。

主角一文字号，17岁，曾因恐龙帝国袭击失去家人，性格冲动好斗，被选为新盖塔1号驾驶员。橘翔驾驶新盖塔2号，沉着冷静，像是队伍中的领导者；大道剀是乐观的大汉，驾驶新盖塔3号，负责海战。神隼人司令员虽不能驾驶，但身手不凡。流龙马在5年前因失忆而退场，后独自旅行，空手道高手，是新盖塔的有力支持。

新盖塔系列中，NISAR基地的研究者们开发了新盖塔，搭载等离子驱动引擎，可通过声控装置操作，拥有各自的特色武器。而真盖塔则是早乙女博士为对抗恐龙帝国所造，与漫画版有显著区别。神盖塔则在决战中展现出强大力量，源自石川贤的画集设计。

动画《真VS新》是对初代《盖塔机器人号》恐龙帝国篇的融合，角色和场景多参考漫画，但实际战斗中，真盖塔和新盖塔并未交手，因此被称为标题欺诈。作为盖塔系列OVA之一，《真VS新》在剧情和内容上显得较为平淡，机战部分虽热血，但篇幅短小，剧情推进较单调。