区别在清晰度、操作系统。

1、清晰度方面。英雄无敌3高清版的视频分辨率高，画面清晰明显。英雄无敌3原版的视频分辨率低，画面有模糊感。

2、操作系统方面。英雄无敌3高清版适应win7以上操作系统。英雄无敌3原版不能适应win7以上操作系统。所以，英雄无敌3高清版和原版在清晰度和操作系统方面存在区别。