菩提祖师在《西游记》中的地位非常特殊，他的修为深不可测，与元始天尊这样的神话人物相提并论。菩提祖师教导孙悟空，传授他仙法秘籍，包括大品天仙决、七十二般变化以及筋斗云等神通，但对他的要求也很严格，尤其是让他保密自己的师门，不许对外透露。菩提祖师是一位学识渊博的世外高人，通晓三教诸子百家之学，其法力高强，却选择在深山洞府中隐居，传授弟子。他给孙悟空取的名字体现了佛家的称呼习惯，与后来的“悟能”和“悟净”相呼应。自从孙悟空离开斜月三星洞后，菩提祖师便不再出现在故事中。

菩提祖师的能力涵盖了三教的知识，当孙悟空选择学习时，菩提祖师提到自己精通百家之学，让孙悟空自行选择学习的内容。他所教授的低级课程就包括了道字门的诸多旁门左道，如请仙扶鸾、趋吉避凶等。菩提祖师讲解大道理时，能够融合道、佛、儒三家的思想，显得非常博学。这表明菩提祖师不拘泥于某一派别，而是博采众长，兼容并蓄。在短短三年内，他还教会了孙悟空七十二般变化和筋斗云等高深仙术。《西游记》中其他神仙难以与菩提祖师相比，即便是如来的佛家和太上老君的道家，也无法与之相比。因此，尽管菩提祖师的名气不大，他却是一位真正的世外高人，法力高强。