《黑神话：悟空》讲述了孙悟空在西游之后的故事。在游戏中，已经成为“斗战胜佛”的孙悟空放弃佛位，选择回到花果山。然而，天庭并不希望他如此逍遥，于是派出二郎神及天兵天将意图捉拿悟空，双方在花果山上空大战一场，最终悟空战败，其“六根”中的五根被夺走并分给了五位妖王，而悟空的“意”则化为奇石留在花果山。此后，无数来自花果山的猴子猴孙为了寻回悟空的“五根”，踏上了挑战妖王的征途。

玩家在游戏中扮演的是一位被称为“天命人”的角色，这位天命人正是众多猴子猴孙中的一员。在经历重重挑战与冒险后，天命人在猪八戒的陪伴与帮助下，成功击败了五位妖王，并找回了悟空失落的“五根”。在这个过程中，玩家会通过天命人的视角，了解到许多与《西游记》原著相关但又有所创新的故事情节，如黄眉怪与金蝉子的对赌、牛魔王的中年危机等。

值得注意的是，游戏中不仅还原了《西游记》中的许多经典妖怪和元素，还融入了当代流行文化和网络文学对《西游记》的再造和延伸。这些创新内容为游戏增添了更多的趣味性和深度，也使得游戏的故事更加丰富和多彩。

最终，天命人带着找回的“五根”进入了孙悟空的生前记忆，战胜了悟空的残存意念和身躯，清除了不净的“六根”，戴上了金刚紧箍，成为了下一个“孙悟空”。这个故事不仅是对《西游记》原著的一种延续和创新，更是对孙悟空这一经典角色的一种新的解读和呈现。