风云雄霸天下2的剧情中，聂风为了拯救武林危机，修炼魔刀却难以摆脱魔性。步惊云和第二梦担心聂风伤害无辜，将他留在孤岛修炼，试图化解他的魔性。然而，聂风的魔性突然爆发，伤了第二梦，随后闯入铁剑门引发混乱。步惊云为阻止他滥杀，与他激战，两人不幸坠入急流，生死未卜。

云被渔家盲女紫凝发现并救回，她父亲虽非江湖人，却对风云之事有所耳闻，担心引来江湖纷争。考虑到云昏迷不醒，可能无法康复，他试图将云丢回海中，紫凝心生不忍，但最终父亲还是决定这么做。第二梦得知风云的下落，不顾伤势寻找，坚信聂风尚在人间。

聂风被海浪卷到岸边，苏醒后深感内疚，决定在凌云窟封闭自己，以避免再伤人。第二梦沿江打听，途中救下孕妇六兰，六兰临终托孤，将孩子交给梦照顾，希望他不要习武。与此同时，一个名叫无二的少年，曾经受尽欺凌，发誓要闯荡江湖。

十二年后，第二梦依然未放弃寻找风云，带着龙儿边做工边寻觅。龙儿对武学充满好奇，私下偷偷练习，逐渐展现不凡身手。在一次事件中，龙儿展现出过人的武技，被铁胆庄庄主看中，希望收他为徒，但梦因龙的擅自学习而拒绝。最终，梦承诺只要龙一年内能胜过她，便可习武。

铁心岛上，怀空师父因病需绝世好剑的剑气，而江湖上对风云和绝世好剑的争夺愈演愈烈，许多门派意图借此扬名立万。而在人间，聂风虽与紫凝成亲，但已失去记忆，过着普通渔夫的生活，一次偶然的冲突，让他再次卷入江湖纷争。

在这段剧情中，风云的命运与江湖恩怨交织，人物之间的关系和冲突不断升级，而寻找真相和回归正道的旅程依然艰难重重。