唐卡的颜色主要分为五大类，包括赤、黑、白、黄、青。

这五种颜色是唐卡绘画中常用的主色，也是藏传密宗佛教理论中与宇宙五大要素相对应的颜色。除此之外，唐卡中还使用了多种其他颜色，如红色、蓝色、绿色、紫色、青色和金色等，这些色彩在唐卡画师的手中表现出了神佛容貌和性格的不同特点，例如白色代表着平静、和蔼和善良，红色和深蓝色则代表威猛、狰狞，而金色则代表神圣的气氛。

唐卡画师是把唐卡绘画需要的所有颜料分为九类：土、石、水、火、木、草、花、骨和宝石。

属于土的颜料有：白土、南碱、金刚土、红土。属石类的颜料有：银矿石、黄铜矿石、云母、青金石、铜绿石、朱砂、玳瑁石、赭石等。属于水类的颜料有：黄丹、桑珠热、蓝靛、铁青靛等。属于火类的颜料有：墨、砒石、雄黄等。

属于木类的颜料有：红树、金树、桦树、硬树、紫梗等。属于草类的颜料有：力士草、鸡爪黄连、狼毒草、苋菜等。属于花类的颜料有：野菊花、桦树花、报春花等。属于骨类的颜料有：蛤、海螺、龙骨等。属于宝石类的颜料有：黄金、白银、天珠、珊瑚、绿松石等 。