一般情况下，两种申报方式即实际出口退税和先抵扣后退税，退税金额应该是相同的。但是，在具体操作过程中，可能会因为各种原因导致退税金额有所不同。例如，如果企业的进项税额比销项税额要多，那么采用先抵扣后退税的方式更加划算；反之，如果进项税额比销项税额少，那么实际出口退税的方式则更有优势。因此，企业选择申报方式时需要根据自身的经营状况和税务筹划情况进行综合考虑。