1. 如果您发现手机不慎下载了含有木马病毒的软件，通常情况下，简单的卸载并不能彻底清除病毒。这是因为木马病毒设计之初就是为了隐藏在系统中，不易被发现和移除。

2. 一些杀毒软件可能会建议您恢复手机出厂设置，但这种方法往往不足以消除病毒，因为木马病毒就是为了避免被常规手段删除。

3. 您可以尝试通过获取手机root权限，然后使用如360手机急救箱等专业工具进行深度查杀。通常，这种方法能够更有效地清除病毒。

4. 如果上述步骤仍然无法彻底清除病毒，那么最后的手段是刷机重装系统。然而，应尽量避免刷机，因为无论是线刷还是卡刷，都存在一定的风险，可能会导致数据丢失或其他问题。

5. 在处理此类问题时，请确保您了解每个步骤的风险，并在可能的情况下备份重要数据，以防不测。安全地使用手机，定期更新操作系统和应用程序，以及使用可信赖的杀毒软件，都是预防病毒感染的重要措施。