在超级机器人大战J的宇宙时代背景下，人类的生活范围已经扩展到了火星附近，然而，这个新时代带来了诸多挑战。地球上的环境问题依旧严峻，如遗传基因调整产生的新人类CO的产生，以及地壳变动背后的神秘异星文明遗迹——オルファン的发现。人们对火星殖民的探索也引发了不少纷争，自然人与新人类之间的紧张关系升级，而被称为"リクレマー"的人士对オルファン遗迹的介入，更是隐藏了关键信息。

宇宙纪元69年，一场来自木星的未知无人兵器入侵火星，导致火星圈的联合军在败退后撤离，留下"木星蜥蜴"这个神秘敌人的标记。他们派遣无敌母舰"郁金香"，地球圈随即陷入与敌人的持久战。在混乱中，有人趁机谋取私利，特别是プラント的独立自卫策略被视为对地球联合的叛逆，大西洋联邦等国家强烈要求对新人类采取强硬措施。

宇宙纪元70年，随着新型战列舰"ナデシコ"由ネルガル重工独立完成，紧张局势达到了新的高潮。不明敌人的身份与木星蜥蜴的战争，加上プラント与地球联合的紧张对峙，这一切在"ナデシコ"的加入下，为故事拉开了序幕……

扩展资料

《超级机器人大战J》是GBA上的最后一款机战，画面上有了很大的进步。剧情故事也非常有新异，整体上说更适合新上手的玩家。