PS超级机器人大战a与a外传的主要区别在于它们的剧情设定和故事发展。

首先，PS超级机器人大战a主要讲述的是对抗外星侵略者的故事，特别是与《飞跃巅峰》中的敌方宇宙怪兽、超时空要塞的巨人族以及原创的巴尔玛帝国军的战斗。在这个版本中，玩家需要操纵各种超级机器人，通过战略和技巧来击败敌人。例如，在剧情的高潮部分，玩家需要利用《飞跃巅峰》中的战舰自爆产生的冲击波来消灭光年范围内的宇宙怪兽军团。

而a外传则是在a的基础上进行的延伸和拓展。外传主要聚焦于实施“神盾计划”的故事，这个计划是为了对抗a版本中战舰自爆产生的冲击波。在外传中，玩家需要使用超级机器人在月球的保护罩发生装置中输入力量，生成一个能够挡住部分冲向地球冲击波的保护罩。然而，计划在实施过程中遭遇了变故，白河愁的叛变和机体爆炸后产生的黑洞将所有人带到了几千年后的地球，此时地球文明已经毁灭，形成了所谓的“黑历史”。

尽管a外传的故事设定和情节发展有其独特之处，但最终玩家还是能够回到原来的时间线，并成功实施神盾计划，改变了地球的未来。这一设定不仅增加了游戏的复杂性和趣味性，也让玩家在游戏中能够体验到更多的剧情发展和情感变化。

综上所述，PS超级机器人大战a与a外传的主要区别在于它们的剧情设定和故事发展。a版本主要聚焦于对抗外星侵略者的战斗，而a外传则更加注重于实施神盾计划的过程以及由此引发的意外事件。这两个版本各有特色，玩家可以根据自己的喜好来选择适合自己的游戏版本。